La Comisión Mixta (Ministerio de Fomento- Ministerio de Educación, Cultura y Deporte) es el órgano encargado de acordar, en sus diferentes reuniones anuales, la financiación de actuaciones en el Patrimonio Histórico español con cargo al 1,5% Cultural. Adicionalmente establece, entre otros aspectos, Programas de actuación, prioridades en los mismos y criterios para aprobación de intervenciones propuestas conforme las disponibilidades presupuestarias.
Esta cooperación entre los dos Departamentos Ministeriales se inició en 1994 y se plasmó en el I Acuerdo de Colaboración entre el Ministerio de Fomento y el Ministerio de Cultura para la actuación conjunta en el Patrimonio Histórico español a través del 1% Cultural de 3 de noviembre de 1994, al que siguieron el II Acuerdo (de 10 de diciembre de 1996); III Acuerdo (de 29 de diciembre de 2000); IV Acuerdo (firmado el 28 de abril de 2005); V Acuerdo de Colaboración suscrito el 3 de marzo de 2009 y el VI Acuerdo vigente, formalizado el 15 de octubre de 2013.