A-039/2006. Accidente ocurrido el día 14 de julio de 2006, a la aeronave CESSNA 172-N, matrícula EC-HQR, operada por Aerotec, en el municipio de El Rosario (Santa Cruz de Tenerife)
A-008/2006. Accidente ocurrido el día 7 de marzo de 2006, a la aeronave Cessna 421C Golden Eagle, matrícula EC-JAX, operada por Aerotaxi Los Valles, en la Sierra de Tajonar (Navarra)
A-021/2006. Accidente ocurrido el día 18 de abril de 2006, a las aeronaves Cessna 172-M, matrícula EC-HAS, y Cessna 172-R, matrícula EC-IYF, operadas por American Flyers España, en las proximidades del Aeródromo de Casarrubios del Monte (Toledo)
A-024/2006. Accidente ocurrido el día 25 de abril de 2006, a la aeronave Aerospatiale SA 316 B, matrícula F-GPJF, operada por Helicópteros de Cataluña, S. A., en La Pobleta de Bellveí (Lleida)
IN-029/2006. Encuentro con turbulencia de estela en el espacio aéreo superior ocurrido el día 28 de mayo de 2006 a la aeronave AIRBUS A320, matrícula EC-JDK, operada por Vueling, en ruta entre Barcelona y Santiago de Compostela
A-031/2006. Accidente ocurrido el 30 de mayo de 2006, a la aeronave modelo AT-802, fabricada por AIR TRACTOR, matrícula EC-GOS, en la pedanía de Fuente-Higuera, término municipal de Molinicos (Albacete)
A-037/2006. Accidente ocurrido el 8 de julio de 2006 al helicóptero SIKORSKY S-61N, matrícula EC-FJJ, en Roque Bermejo (Tenerife – Islas Canarias – España)
A-043/2006. Accidente ocurrido el día 27 de julio de 2006, a la aeronave Piper PA-28RT-201T, matrícula EC-ENR, en el término municipal de Deba (Guipúzcoa)
A-059/2006. Accidente ocurrido el día 7 de octubre de 2006, a la aeronave modelo PZL M-18A DROMADER, matrícula EC-FBI, operada por AVIALSA, en las inmediaciones del aeródromo de Castellón
A-064/2006. Accidente ocurrido el 15 de diciembre de 2006, a la aeronave Piper PA-34-220T, matrícula EC-HOL, en aproximación a la pista 02 del Aeropuerto de Jerez (Cádiz – España)